Γνωρίστε τους Έλληνες iGEMers!

Στην προσπάθεια ανάδειξης της συμμετοχής προπτυχιακών και μεταπτυχιακών φοιτητών στον Διεθνή Διαγωνισμό Συνθετικής Βιολογίας, iGEM, σας παρουσιάζουμε το ερευνητικό έργο των ελληνικών ομάδων για το 2021.


Γνωρίστε την iGEM Athens 2021


Για το 2021, η ομάδα iGEM Athens απαρτίζεται από 7 άτομα. Όλοι ήταν μέλη και της ομάδας iGEM Athens 2020 και συνεχίζουν με ενθουσιασμό για δεύτερη χρονιά. Οι Κλεονίκη Πυλαρινού, Βασιλεία Σπυριδάκη, Ηλίας Τούμπε, Ελευθερία Κελεφιώτη Στρατηδάκη είναι προπτυχιακοί φοιτητές της Σχολής Χημικών Μηχανικών του ΕΜΠ, η Μαριάννα Ιωαννίδου είναι προπτυχιακή φοιτήτρια του τμήματος Βιοτεχνολογίας του ΓΠΑ, η Ορσαλία Βελουδίου είναι προπτυχιακή φοιτήτρια της Ιατρικής Σχολής του ΕΚΠΑ και ο Σπύρος Κανελλόπουλος είναι απόφοιτος του τμήματος Βιολογίας του ΕΚΠΑ.



Φέτος, με το ερευνητικό της έργο, η ομάδα στοχεύει να αντιμετωπίσει τους περιορισμούς που εμφανίζονται σχετικά με την προσβασιμότητα και την παραγωγή των πρώτων υλών της PCR, μίας μεθόδου η οποία χρησιμοποιείται καθημερινά σε ερευνητικά εργαστήρια και διαγνωστικά κέντρα σε όλο τον κόσμο. Κάθε αντίδραση PCR απαιτεί, ανάμεσα στα άλλα, μία πολυμεράση και τα τέσσερα μονομερή (dNTPs) που θα δομήσουν το τελικό προϊόν. Ωστόσο, το κόστος παραγωγής των dNTPs είναι υψηλό, ενώ πολλές φορές παράγονται από πολύπλοκες, χαμηλής απόδοσης και μη βιώσιμες χημικές διεργασίες. Επιπλέον, οι τεχνικές PCR πραγματοποιούνται μόνο σε κεντρικά εργαστήρια από μικρές ομάδες ερευνητών και ακριβό εξοπλισμό. Τα προβλήματα αυτά μπορούν να γενικευθούν σε όλες τις τεχνικές ενίσχυσης νουκλεϊκών οξέων. Χρησιμοποιώντας τις αρχές της Συνθετικής Βιολογίας, η ομάδα σχεδιάζει ένα γενετικό κύκλωμα το οποίο θα παράγει την Pfu πολυμεράση και τα ένζυμα RNR και TSase, απαραίτητα για την παραγωγή των dNTPs. Στόχος της iGEM Athens 2021, είναι να κάνει τις τεχνικές ενίσχυσης νουκλεϊκών οξέων περισσότερο προσβάσιμες σε μη κεντρικές εγκαταστάσεις!



Ακολουθήστε το ταξίδι της iGEM Athens 2021 στο Instagram και το Facebook. Επικοινωνήστε με την ομάδα στο igemathens2021@gmail.com. Υποστηρίξτε το έργο της ομάδας, εδώ!



Γνωρίστε την iGEM NOUS 2021


Η iGEM NOUS είναι μια νέα διεπιστημονική ομάδα με φοιτητές από όλη την Ελλάδα. Η ομάδα απαρτίζεται από 12 φοιτητές από 8 διαφορετικά τμήματα, Ιατρικής, Βιολογίας, Πληροφορικής με εφαρμογές στην Βιοϊατρική, Μοριακής Βιολογίας & Γενετικής, Φυσικής, Πληροφορικής, Οικονομικών και Γραφιστικού Σχεδιασμού, σε 4 διαφορετικές πόλεις, Αλεξανδρούπολη, Αθήνα, Θεσσαλονίκη και Λαμία. Την ομάδα υποστηρίζουν οι καθηγητές Ελένη Καλδούδη, Νικόλας Μ. Γλυκός, Μαρία Μάρτζυ Κόφφα, Γεώργιος Δροσσάτος και Γεώργιος Δρόσσος και δραστηριοποιείται υπό την αιγίδα του Δημοκριτείου Πανεπιστημίου Θράκης.



Στην πρώτη της συμμετοχή στον διαγωνισμό, με το ερευνητικό έργο «Ηπιόνη», η ομάδα ελπίζει να προσφέρει σε εκατοντάδες ανθρώπους που πάσχουν από Οστεοαρθρίτιδα, την ευκαιρία να περπατήσουν ξανά χωρίς κάποιον περιορισμό ή πόνο, σχεδιάζοντας μια καινοτόμα και μη επεμβατική μέθοδο θεραπείας. Η Οστεοαρθρίτιδα είναι η πιο συχνή μυοσκελετική πάθηση παγκοσμίως, οδηγώντας πολλές φορές μέχρι και σε παράλυση. Η προτεινόμενη θεραπεία περιλαμβάνει την ένεση γενετικά τροποποιημένων κυττάρων στην προσβληθείσα άρθρωση. Η iGEM NOUS 2021, έχει σχεδιάσει ένα πλασμίδιο το οποίο δίνει στα κύτταρα την δυνατότητα να παράγουν εξωσώματα με ένα συγκεκριμένο πεπτίδιο «οδηγό» (Chondrocyte Affinity Peptide), έτσι ώστε αυτά να στοχεύουν ειδικά τα χονδροκύτταρα, καθώς και ένα microRNA το οποίο καταλήγει τελικά στα χονδροκύτταρα αναστέλλοντας την έκφραση πρωτεϊνών που συμμετέχουν στην καταστροφή του χόνδρου και ενισχύοντας την έκφραση πρωτεϊνών που συμμετέχουν στον σχηματισμό νέου χόνδρου. Τα γενετικά αυτά τροποποιημένα κύτταρα, θα ενίονται στην άρθρωση του ασθενή, σταματώντας την επιδείνωση της πάθησης και ανακουφίζοντας τον ασθενή από τον πόνο της Οστεοαρθρίτιδας.



Ακολουθήστε το ταξίδι της iGEM NOUS 2021 στο Instagram, το Facebook, το Twitter, το Linkedin και το YouTube. Επικοινωνήστε με την ομάδα στο igemnous@gmail.com.



Γνωρίστε την iGEM IOANNINA 2021


Η ομάδα iGEM IOANNINA είναι η πρώτη ομάδα iGEM που θα εκπροσωπήσει φέτος το Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων στον Διεθνή Διαγωνισμό Συνθετικής Βιολογίας. Απαρτίζεται από 12 φοιτητές του Πανεπιστημίου Ιωαννίνων των τμημάτων Βιολογικών Εφαρμογών και Τεχνολογιών (Κωνσταντίνος Αφορδακός, Ελισάβετ Ασλανίδου, Κυράνια Χριστοφή, Ανδρέας Βάσιος, Χρυσούλα Τζήμα, Δέσποινα Βούλγαρη και Κωνσταντίνος Κουτσογιάννης), Ιατρικής (Φωτεινή Αλεξίου και Γιώργος Ευσταθίου), Μηχανικών Η/Υ και Πληροφορικής (Χρήστος Γεωργίου-Μούσσες και Αθανάσιος Παπαναστασίου) και Αρχιτεκτονικής (Μαρία Σκεύα). Οι primary PIs (Principal Investigators) που συνδράμουν στην προσπάθεια της ομάδας είναι οι Αναπληρωτές Καθηγητές Πέτρος Μαραγκός και Θεολόγος Μιχαηλίδης, ενώ οι secondary PIs είναι ο Επίκουρος Καθηγητής Δημήτριος Αλίβερτης και η Δρ. Λευκοθέα-Βασιλική Ανδρέου. Οι προαναφερθέντες ανήκουν στο Προσωπικό του Τμήματος Βιολογικών Εφαρμογών και Τεχνολογιών του Πανεπιστημίου Ιωαννίνων.



Στόχος της ομάδας, μέσω του ερευνητικού της έργου ‘’Anti-bye-otic’’, είναι η δημιουργία ενός βακτηριακού μηχανισμού, ο οποίος θα καταστρέφει αντιβιοτικά και παράγωγά τους, τα οποία βρίσκονται στο έδαφος και συνεισφέρουν στην αύξηση των ανθεκτικών βακτηριακών στελεχών. Η αλόγιστη χρήση αντιβιοτικών έχει επιτρέψει την αύξηση των βακτηρίων που εμφανίζουν ανθεκτικότητα στα συγκεκριμένα αντιβιοτικά, καθιστώντας τα σε δεύτερο χρόνο αναποτελεσματικά. Προτείνεται ως λύση η καταστροφή των υπολειμματικών ποσοτήτων των αντιβιοτικών στο έδαφος σύμφωνα με τις αρχές της Συνθετικής Βιολογίας, ώστε να καμφθεί η πιθανότητα εμφάνισης ανθεκτικών στελεχών σε αυτά, προασπίζοντας την Ενιαία Υγεία.



Ακολουθήστε το ταξίδι της iGEM IOANNINA 2021 στο Instagram, το Facebook και το Twitter. Επικοινωνήστε με την ομάδα στο igemioannina@gmail.com. Υποστηρίξτε το έργο της ομάδας, εδώ!



Γνωρίστε την iGEM Thessaloniki 2021


Η iGEM Thessaloniki είναι η διεπιστημονική ερευνητική ομάδα η οποία θα εκπροσωπήσει το Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης, στον Διεθνή Διαγωνισμό Συνθετικής Βιολογίας. Η ομάδα αποτελείται από 11 μέλη, φοιτητές των τμημάτων Βιολογίας, Ηλεκτρολόγων Μηχανικών και Μηχανικών Υπολογιστών, Πληροφορικής, Φαρμακευτικής, Φυσικής και Χημείας του Αριστοτέλειου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης και του τμήματος Μοριακής Βιολογίας και Γενετικής του Δημοκριτείου Πανεπιστημίου Θράκης. Την ομάδα καθοδηγεί ο o Δρ. Βιζιριανάκης Ιωάννης, Αναπληρωτής Καθηγητής Φαρμακολογίας του τμήματος Φαρμακευτικής του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης.


Για το 2021, η ομάδα σχεδιάζει ένα φθηνό και μη-επεμβατικό εργαλείο για τη διάγνωση του αδενοκαρκινώματος του παγκρέατος, του πιο συχνού τύπου παγκρεατικού καρκίνου. Με στόχο την έγκαιρη διάγνωση της νόσου και επομένως, την πιο αποτελεσματική θεραπεία, ή ομάδα σχεδιάζει ένα σύστημα για την in vitro ανίχνευση συγκεκριμένων miRNAs τα οποία εμφανίζονται σε αυξημένες ποσότητες στα ούρα ασθενών, στο πρώτο και δεύτερο στάδιο του καρκίνου αυτού. Συγκεκριμένα, το σύστημα αποτελείται από συνθετικά μόρια RNA τα οποία ονομάζονται Toehold Switches και λειτουργούν ως ένα είδος μοριακού διακόπτη, ο οποίος επιτρέπει την παραγωγή φθορισμού αν ανιχνεύονται τα miRNAs στο δείγμα. Το ερευνητικό έργο της ομάδας, ονομάζεται METIS (MicroRNAs Expression Toehold Investigation System), ένα όνομα εμπνευσμένο από την Μήτιδα, θεότητα της καινοτομίας και της τεχνογνωσίας στην ελληνική μυθολογία.



Ακολουθήστε το ταξίδι της iGEM Thessaloniki 2021 στο Instagram, το Facebook και το LinkedIn. Επικοινωνήστε με τη ομάδα στο igemthessaloniki@gmail.com.



Γνωρίστε την iGEM Thessaly 2021


Η διεπιστημονική ομάδα του Πανεπιστημίου Θεσσαλίας iGEM Thessaly συμμετέχει για 3η συνεχόμενη φορά στον Διεθνή Διαγωνισμό iGEM αυτή τη φορά με το ερευνητικό έργο Amalthea. Η ομάδα συγκροτείται από 12 προπτυχιακούς φοιτητές από τα τμήματα Βιοχημείας και Βιοτεχνολογίας, Μηχανολόγων Πληροφορικής, Ηλεκτρολόγων Μηχανικών και Μηχανικών Υπολογιστών και Αρχιτεκτόνων του Πανεπιστημίου Θεσσαλίας


Το ερευνητικό έργο Amalthea αποτελεί συνέχεια της περσινής συμμετοχής της ομάδας στον διαγωνισμό, που στόχευε στην δημιουργία μιας μικροκάψουλας για την άμεση και μη επεμβατική διάγνωση των Ιδιοπαθών Φλεγμονωδών Νοσημάτων του Εντέρου (ΙΦΝΕ). Φέτος η iGEMThessaly 2021 συνεχίζει την ερευνητική της δραστηριότητα, στοχεύοντας στην λειτουργική αξιολόγηση του μικροβιώματος του εντέρου κάνοντάς την προσιτή και εύκολη σε όλους τους ανθρώπους. Με αυτό τον τρόπο γίνεται ανίχνευση της δυσβίωσης του εντερικού μικροβιώματος, απόρροια του λανθασμένου διατροφικού προτύπου της σύγχρονης εποχής, και δρα προληπτικά σε σοβαρές γαστρεντερικές παθήσεις όπως ο καρκίνος του παχέος εντέρου και η παχυσαρκία. Η κάψουλα ανιχνεύει τα επίπεδα των λιπαρών οξέων βραχείας αλυσίδας (SCFAs), μεταβολιτών των βακτηρίων του εντέρου που αποτελούν βιοδείκτη για την υγεία του εντερικού μικροβιώματος. Η μετατροπή του σήματος μέσω ενός συστήματος NOT-GATE επιτρέπει τη διάκριση της έλλειψης των μεταβολιτών αυτών. Σε περίπτωση ταυτοποίησης εντερικής δυσβίωσης, παρέχεται ένα προβιοτικό διατροφικό συμπλήρωμα, ένα θεραπευτικό μέσο (living biotherapeutic) το οποίο έχει την δυνατότητα της εξατομικευμένης αναπλήρωσης των επιπέδων των SCFAs. Μέσω της ολιστικής προσέγγισής, η ομάδα στοχεύει στη βελτίωση της ευημερίας και τη μείωση τυχόν παραγόντων κινδύνου που μπορούν να οδηγήσουν σε σοβαρές ασθένειες. Το έργο της ομάδας ενσωματώνει τις εκκλήσεις για διασφάλιση της επισιτιστικής ασφάλειας και την δημιουργία των χαρακτηριστικών ενός βιώσιμου συστήματος τροφίμων στην κοινωνία, μέσω ενός εύχρηστου εργαλείου πρόληψης για την υγεία του εντέρου.



Ακολουθήστε το ταξίδι της iGEM Thessaly 2021 στο Instagram, το Facebook, το Twitter και το YouTube. Επικοινωνήστε με τη ομάδα στο igem.thessaly@gmail.com.



Οι ομάδες θα διαγωνιστούν στο Giant Jamboree 2021 που θα πραγματοποιηθεί διαδικτυακά 4 – 14 Νοεμβρίου. Ανακαλύψτε το έργο και τις διακρίσεις όλων των Ελληνικών ομάδων iGEM, εδώ.


Για περισσότερα νέα ακολουθήστε το #synbioGR σε Twitter, Facebook και LinkedIn.